El BTUCH está localizado en el Servicio de Anatomía Patológica del Hospital Clínico de la Universidad de Chile. Este unidad está conectada a la red de emergencia del Hospital, tiene una red eléctrica estabilizada y cuenta con equipos de última generación. Su planta física está compuesta por un laboratorio con estándar de biología molecular, sala de recepción y procesamiento de muestras de fluidos y tejidos, sala de freezer y sala administrativa.