COLABORACIONES

Estamos trabajando en múltiples colaboraciones con grupos de investigación nacionales e internacionales, entre estos proyectos se encuentran:

• Centro de Prevención y Control de Cáncer (CECAN). Director: Bruno Nervi, Director alterno: Enrique Castellón. Financiamiento: FONDAP (2023-2027).
• COVID-19 Genomics Network (C19-GenoNet). IP: Ricardo Verdugo. Financiamiento: Anillo ACT210085 (2022-2024).
• Sistema Integrado de Servicios Informáticos para Investigación e Innovación en Biomedicina y Datos Clínicos. IP. Mauricio Cerda. Financiamiento: Fondequip EQM 210020 (2022-2024).
• A Human Cell Map of Latin American Diversity. IPs: Andrés Moreno-Estrada/ Ricardo Verdugo. Financiamiento: Chan Zuckerberg Initiative (CZI) 2021-240108 (2021-2024).
• Pharmacogenomic variants and tumor mutation profiling as modifiers of the clinical response after 5-fluorouracil-based chemotherapy in patients with metastatic colorectal cancer. IP: Dr. Luis Quiñones. Financiamiento: Fondecyt 1211948 (2021-2024).
• Consorcio Latinoamericano para Investigación en Genética de la Enfermedad de Parkinson (LARGE PD). Estudio genético de pacientes con enfermedades de Parkinson. IP: Ignacio Mata. Financiamiento: Parkinson´s Foundation/American Parkinson’s Disease Association (2020-2023).
• Constitución y uso del Consorcio Europeo-Latinoamericano para la erradicación del cáncer de vesícula biliar prevenible – EULAT Eradicate GBC. IP: Justo Lorenzo Bermejo. Financiamiento: EU Horizon 2020 Innovation (2019-2024).
• Immune response and gastric damage transition from child to adult in symptomatic Helicobacter pylori infected individuals: dynamic and host/pathogen/microbiota determinants. IP: Yalda Lucero. Financiamiento: Fondecyt 1190456 (2019-2023).
• Gastric Cancer Precursor Lesions. IPs: Constanza Camargo y Alejandro Corvalán. Financiamiento: National Cancer Institute (2017-2023).
• "Validación de un Biomarcador Combinado para el Diagnóstico Precoz de Injuria Renal Aguda: Estudio Clínico Prospectivo Multicéntrico". IP: Luis Michea. Financiamiento: FONDEF IdeA 19I10282 (2019-2021).
• TumorSec: Optimización, validación y masificación de un ensayo de secuenciación de genes para mejorar la precisión de terapias oncológicas. IP: Katherine Marceline. Financiamiento FONDEF IdeA IT16I10051 (2017-2019).

CONTRIBUCIONES

El BTUCH también ha contribuido a la ejecución de múltiples proyectos que han sido usuarios de nuestras colecciones o servicios, entre ellos:

• A Personalized Medicine Approach to Improve the Prediction of anti-TNF Response in Patients with Rheumatoid Arthritis. IP: Roberto Díaz. Financiamiento: Fondecyt Regular 1220540 (2022-2025).
• Ensayo de “tamizaje y tratamiento” para erradicación de Helicobacter pylori en adolescentes de 16-18 años residentes de tres comunas de Chile: eficacia e implicancias microbiológicas en el huésped. IP: Miguel O’Ryan Gallardo. Financiamiento: Fondecyt Regular 1220964 (2022-2024).
• A Prospective Observational Cohort Study to Develop a Predictive Model of Taxane-Induced Peripheral Neuropathy in Cancer Patients. Red Colaborativa GOCCHI-SWOG. IP: Mehna S. Trivedi. Financiamiento: SWOG (2020-2024).
• Impacto clínico de la clasificación molecular del cáncer colorrectal: un paso crucial hacia la medicina personalizada. IP: Jaime González. Financiamiento: FONIS SA20I0059 (2021-2023).
• Sherlock Lung. Rastreo de procesos mutacionales en cáncer de pulmón en personas no fumadoras. IP: María Teresa Landi. Financiamiento: National Cancer Institute (2020-2023).
• The upregulation of long-noncoding RNA, a novel opportunity to address the complexities of the pathogenesis of gastric cancer. IP: Alejandro Corvalan. Financiamiento: Fondecyt Regular 1191928 (2019-2023)
• Participación de la desmetilasa FTO (fat-mass and obesity associated protein) en procesos de transición mesenquimal y cancer stem cell en cáncer colorrectal. IP: Glauben Landskron. Financiamiento: Fondecyt  Postdoctorado 3190931 (2019-2022).
• Identificación de péptidos antigénicos inmunodominantes y de respuestas de células T en artritis reumatoide: Un paso en el desarrollo de una terapia antígeno-específica basada en células dendríticas para el restablecimiento de la auto-tolerancia. PI. Juan Carlos Aguillón. Financiamiento Fondecyt Regular 1181853 (2018-2022).
• Búsqueda de genes involucrados en cáncer gástrico hereditario y esporádico. IPs: Graciela Molina. Financiamiento: Becas- Chile ANID 741900063 (2019-2021).
• Evaluación del papel de los microRNAs sobre la susceptibilidad y fisiopatología del cáncer gástrico. IP: Yolanda Espinosa. Financiamiento: Fondecyt Regular 1170446 (2017-2023)
• Nonsyndromic Orofacial clefts in Chile: the role of parental biomarkers of folate/onecarbon metabolism. IP. José Suazo. Financiamiento: Fondecyt Regular 1170805 (2017-2021).

ARTÍCULOS CIENTÍFICOS

2022

• The Transcriptomic Portrait of Locally Advanced Breast Cancer and Its Prognostic Value in a Multi-Country Cohort of Latin American Patients. Frontiers in Oncology. 2022 March 22;12. doi: 10.3389/fonc.2022.835626. 
• Socioeconomic, Clinical, and Molecular Features of Breast Cancer Influence Overall Survival of Latin American Women. Frontiers in Oncology. 2022 March 8;12. doi: 10.3389/fonc.2022.845527. 
• Identification of Circulating lncRNAs Associated with Gallbladder Cancer Risk by Tissue-Based Preselection, Cis-eQTL Validation, and Analysis of Association with Genotype-Based Expression. Cancers. 2022; 14(3):634. https://doi.org/10.3390/cancers14030634
• Development of an Application for Electronic Retrieval of Patient and Sample Information in Latin American Regions with a High Incidence of Gallbladder Cancer. Journal of Personalized Medicine. 2022; 12(9):1476.
• Biobancos en otorrinolaringología. Revista de otorrinolaringología y cirugía de cabeza y cuello, 82(1), 136-146. https://dx.doi.org/10.4067/s0718-48162022000100136

2021

• Validation of an NGS Panel Designed for Detection of Actionable Mutations in Tumors Common in Latin America. Journal of Personalized Medicine. 2021 Sep 8;11(9):899. doi: 10.3390/jpm11090899. 
• Epigenome-Wide Analysis of Methylation Changes in the Sequence of Gallstone Disease, Dysplasia, and Gallbladder Cancer. Hepatology. 2021 Jun;73(6):2293-2310. doi: 10.1002/hep.31585.
• Gallstones, Body Mass Index, C-Reactive Protein, and Gallbladder Cancer: Mendelian Randomization Analysis of Chilean and European Genotype Data. Hepatology. 2021 May;73(5):1783-1796. doi: 10.1002/hep.31537.

2020

• ABCB1/4 gallbladder cancer risk variants identified in India also show strong effects in Chileans. Cancer Epidemiology . 2020 Apr;65:101643. doi: 10.1016/j.canep.2019.101643. 
• Nonsyndromic orofacial clefts in Chile: LINE-1 methylation and MTHFR variants. Epigenomics. 2020 Oct;12(20):1783-1791. doi: 10.2217/epi-2020-0021. 
• Genetic variants in S-adenosyl-methionine synthesis pathway and nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate in Chile. Pediatric Research 89, 1020–1025 (2021). https://doi.org/10.1038/s41390-020-0994-3.

2019

• Corrigendum: Interleukin 33/ST2 Axis Components Are Associated to Desmoplasia, a Metastasis-Related Factor in Colorectal Cancer. Frontiers in Immunology. 2019 Sep 24;10:2149. doi: 10.3389/fimmu.2019.02149. 

2018

• Polymorphisms in RAS/RAF/MEK/ERK Pathway Are Associated with Gastric Cancer. Genes (Basel). 2018 Dec 28;10(1):20. doi: 10.3390/genes10010020.
• The relationship between chemokines CCL2, CCL3, and CCL4 with the tumor microenvironment and tumor-associated macrophage markers in colorectal cancer. Tumor Biology. 2018 Nov;40(11):1010428318810059. doi: 10.1177/1010428318810059. 
•  

2017

• Subtypes of Native American ancestry and leading causes of death: Mapuche ancestry-specific associations with gallbladder cancer risk in Chile. PLoS Genetics. 2017 May 25;13(5):e1006756. doi: 10.1371/journal.pgen.1006756.